Гетероауксин (3-индолуксусная кислота, индол-3-уксусная кислота, IAA) еще одно соединение, обнаруживаемое в мухоморе, связанное с биосинтетическим путём триптофана/триптамина. Это наиболее распространённый природный фитогормон из группы ауксинов, основная функция которого — стимуляция растяжения клеток.

IAA синтезируется не только высшими растениями, но и грибами, лишайниками, микроводорослями, а также симбиотическими эндофитными бактериями в корневой системе. Он регулирует широкий спектр процессов: деление клеток, опадение листьев, цветение, плодоношение.

Установлено, что у Tricholoma vaccinum, вступающего в симбиоз с елью, гетероауксин усиливает рост и ветвление как грибного мицелия, так и корешков растения. Гриб стимулирует собственное развитие: гетероауксин, выделяемый мицелием, активирует проникновение гиф в межклеточное пространство корня и способствует формированию сети Гартига.

Предполагается, что аналогичная функция гетероауксина реализуется и у мухоморов — он регулирует рост мицелия и формирование плодовых тел. Влияние IAA на организм человека остаётся неизученным.